El Doctorado en Estudios Críticos de Género une departamentos como Arte, Ciencias Sociales y Políticas, Ciencias Religiosas, Comunicación, Derecho, Desarrollo Humano, Economía, Estudios Internacionales, Filosofía, Literatura, Historia, Psicología e INIDE, que pertenecen a las direcciones de las Divisiones de Estudios Sociales, Humanidades y Comunicación de la Universidad Iberoamericana, con los principios contenidos en su Ideario y Filosofía Educativa, con lo que busca contribuir al logro de la Misión institucional a partir del fomento a la reflexión crítica sobre diversas problemáticas que afectan la realidad mexicana y mundial, como la desigualdad, la inequidad, la discriminación, las estructuras machistas y la violencia, a nivel personal, social e institucional.

A través de las teorías y metodologías de los estudios de género se percibe, piensa, elige y actúa en favor de los derechos humanos y de la construcción de relaciones humanas y sociales inclusivas, igualitarias, libres, amorosas, justas y con perspectiva ética para conformar comunidades respetuosas de la dignidad humana y de los libres procesos personales de subjetivación.

Formar personas capaces de generar y difundir conocimientos sobre género a partir de un enfoque crítico y transdisciplinario para incidir de manera creativa en la solución de problemas y en la construcción de sociedades más justas, incluyentes, humanas, libres y solidarias.

• Generar conocimiento con base en nuevos acercamientos epistemológicos de los estudios de género para la deconstrucción de una visión excluyente de la sociedad en términos de género. 
• Analizar las relaciones entre/intra-sexos, géneros, generacionales y étnicas a partir de teorías y metodologías de las diferentes disciplinas que dialogan con los estudios de género de tal manera que fortalezcan y acompañen las demandas de los nuevos sujetos emergentes y las temáticas y problemáticas sociales actuales en aras de una sociedad más justa. 
• Difundir conocimiento que fundamente la reflexión crítica sobre las diferencias socialmente construidas con base en el género, el sexo, la clase, la etnia, la edad y la orientación sexual que están inscritas en prácticas sociales, ámbitos de la vida cotidiana, ideologías, representaciones culturales y sistemas simbólicos en espacios académicos y públicos, nacionales e internacionales. 
• Formular estrategias para aminorar o resolver problemáticas relacionadas con los temas de género, fundamentadas en los marcos teóricos, metodológicos y de la realidad social. 

El Plan de este doctorado cuenta con 3 ejes:

1. Teórico: Son 4 materias teóricas obligatorias que contienen los conocimientos más importantes de las teorías de los estudios de género desde diversas disciplinas.

2. Metodológico: Son 8 materias de metodología, de síntesis y evaluación, con el fin de dar seguimiento puntual al alumnado en su trabajo de tesis.

3. Optativo: Son 4 materias cursativas obligatorias, pero que pueden elegirse temas de acuerdo con los intereses de la tesis a realizar. Al final del cuarto semestre, sólo restan materias de seguimiento a la tesis, por lo que ya no hay materias cursativas como tal. Sino que es tiempo estipulado para la elaboración de la tesis y su concreción en tiempo y forma.